下記手順にてGoogle Appsで管理しているユーザーを停止させることが可能です。※もちろん復活もさせることができます。
+Google Apps 管理者用コントロール パネルにログインします。 +ユーザー アカウントを見つけます。 +ユーザー情報ページを表示するユーザー アカウントの行をクリックします。 +右上にある [ユーザーを停止] をクリックします。 +確認ボックスで [OK] をクリックします。
ユーザーが停止されたことを確認するには、[組織とユーザー] タブをクリックし、目的のユーザーの [ステータス] 列が [強制停止] になっているかどうかを確認します。
参考URL：http://support.google.com/a/bin/answer.py?hl=ja&answer=33312